Der er flere måder at behandle flisepest på. Først og fremmest er det vigtigt, at forstå hvorfor flisepesten vokser. Som nævnt tidligere er der tale om en form for lavsvamp, der trives i fugtige og mørke forhold. Har du træer eller buske, der skygger for sollys på terrassen, er det perfekte forhold for alger og flisepest, da de ikke må få for meget lys. Du kan derfor med fordel skære bevoksning væk, der dækker for sollys på terrassen. Det er dog sjældent nok til at afhjælpe problemet helt.

Uden vand gror alger og flisepest ikke. Derfor vil en overdækket terrasse sjældent være særlig hårdt ramt. Dog kan lavsvampen optage vand fra luften, så hvis luftfugtigheden er høj, kan man alligevel opleve problemer med både alger og flisepest.

Som nævnt tidligere er alger og lavsvamp ikke glad for syre. Derfor kan det være fristende blot at hælde eddikesyre direkte på fliserne, og det vil også effektivt kunne dræbe både alger og flisepest. Desværre ætser syren også overfladen på belægningen. Det gør den rug, og skabe gode vilkår for fornyet algevækst. Af samme grund bør man også helt undgå at rense fliserne direkte med en højtryksrenser. Det høje vandtryk beskadiger overfladen på belægningen, og i sidste ende, vil man få et dårligere resultat end udgangspunktet.

Det kan også hjælpe på problemet at overdække fliserne vinteren over. Det kan gøres med en presenning, eller et godt lag grus eller sand. Alger og lav skal bruge kuldioxid til at lave fotosyntese, og de bliver derfor kvalt hvis man dækker fliserne til. Hvor effektivt det er, afhænger af hvordan fliserne bliver dækket til, og ikke mindst hvor slemt fliserne er ramt af alger og flisepest. Der kan være mange andre grunde til at man ikke ønsker, eller har mulighed for at overdække sin terrasse hele vinteren. Derfor mener vi, at afrensning af fliser er en bedre løsning for de fleste. Det kræver en del knofedt og hårdt arbejde, men giver ubetinget det bedste vedvarende resultat.